Segundo o Ministério da Saúde em várias cidades, incluindo algumas de SC, teriam, aplicado vacinas trocadas ao ministrar a Segunda dose. Por exemplo, alguém que tomou a primeira dose do Coronavac e recebeu a segunda da AstraZenica ou vice-versa.
Das cidades de SC consta Bocaina do Sul que teria feito mais de dez de vacinas trocadas. Contudo, a secretaria da Saúde do município observa que não houve a troca, o erro foi no registro no sistema do ministério. Embora fosse solicitada a correção, ainda permanece errado.