O acervo do Museu Thiago de Castro adquirido pelo IFHAN e entregue para administração da Prefeitura de Lages, passará por um inventário. Isto se dará no período de um ano. Nesse tempo também se dará a transição administrativa.
Atualmente, uma equipe autônoma, ou seja, ligada aos antigos proprietários do museu, com apoio da Associação Amigos do Museu Thiago de Castro ainda é a responsável pela administração.
A prefeitura repassa mensalmente ao museu um valor de R$ 3 mil para ajuda com as despesas de pagamento de funcionários, entre outros serviços.